期刊简介
《辽宁中医杂志》是综合性中医药学术月刊， 1958年创刊。辽宁省卫生厅主管，辽宁中医药大学主办。深受国内外广大作者、读者的喜爱，曾荣获中国期刊方阵双效期刊、中国自然科学核心期刊、中国中文核心期刊、中国生物医学核心期刊、中国中医药优秀期刊等殊荣。本刊编排规范，内容充实，面向基层，注重临床实践。适宜各级中医、中西医结合工作者和中医爱好者阅读。欢迎广大读者订阅。
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首页>辽宁中医杂志
- 杂志名称：辽宁中医杂志
- 主管单位：辽宁省卫生厅
- 主办单位：辽宁中医药大学,辽宁省中医药学会
- 国际刊号：1000-1719
- 国内刊号：21-1128/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国中文核心期刊期刊收录：北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 上海图书馆馆藏, 农业与生物科学研究中心文摘, CA 化学文摘(美), 万方收录(中), 哥白尼索引(波兰), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
乌拉尔甘草EST资源的SSR信息分析
刘越；黄怡鹤；孙洪波；冯金朝；张水仙；王真；戴景峰；黄璐琦
关键词：乌拉尔甘草, EST, SSR分析
摘要：目的:为了在乌拉尔甘草中开发功能性EST - SSR分子标记,分析乌拉尔甘草EST - SSRs特征.方法:从NCBI公共数据库中下载乌拉尔甘草EST序列,运用DNAstar软件中的Seqman Pro程序,对下载序列进行拼接和聚类,去除冗余序列,利用SSRIT软件筛选重复序列长度≥20 bp的二、三、四、五核苷酸4种类型的SSR,统计分析乌拉尔甘草EST - SSR的特征.结果:从NCBI公共数据库中下载50666条乌拉尔甘草EST序列,剔除冗余序列,得到全长为9.28×106 bp的无冗余EST序列11100条.在这些序列中搜索出752条EST序列含有963个SSR,占无冗余EST序列的8.68％,平均每9.64 kb EST出现1个SSR位点.二核苷酸重复基元SSR出现频率高(43.41％),其次是三核苷酸(41.95％),AG/TC、GA/CT和CTT/GAA是二、三核苷酸中的优势重复基元.乌拉尔甘草EST - SSR以4～ 10次重复为主,基序长度主要集中于20～30bp.结论:乌拉尔甘草EST - SSR的出现频率高,重复类型丰富,理论上表明这些EST-SSR具有较高的可用性.本文通过对乌拉尔甘草EST资源的SSR信息的研究,为分子水平和生物信息学角度上开发乌拉尔甘草的SSR功能性标记提供了候选序列.
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